慢性直腸炎通常難以自愈，但部分癥狀較輕的患者可能通過調整生活方式得到緩解。慢性直腸炎可能與免疫異常、感染、長期飲食刺激等因素有關，建議患者及時就醫明確病因。
慢性直腸炎屬于腸道慢性炎癥性疾病，其病理改變涉及黏膜屏障損傷和免疫調節紊亂。對于因飲食不當或輕度感染誘發的患者，通過嚴格避免辛辣刺激食物、減少高脂飲食攝入、補充膳食纖維等措施，部分癥狀如腹瀉、肛門墜脹感可能逐漸減輕。但黏膜的炎癥反應往往持續存在，若不進行規范治療可能反復發作或加重。部分患者因腸道菌群失衡導致癥狀遷延，需通過益生菌調節微生態環境。
若慢性直腸炎與自身免疫性疾病相關，如潰瘍性結腸炎直腸型或克羅恩病，自愈概率極低。這類疾病通常伴隨淋巴細胞浸潤和黏膜潰瘍，需長期使用氨基水楊酸制劑控制炎癥活動。當出現腸壁纖維化、狹窄或瘺管形成時，甚至需要外科手術干預。部分特殊感染如結核性直腸炎或放射性直腸炎，必須針對原發病因治療才能改善癥狀。
慢性直腸炎患者應保持低渣飲食，避免酒精和咖啡因刺激，規律監測排便性狀變化。建議每半年進行一次腸鏡復查，評估黏膜愈合情況。合并貧血或營養不良時需補充鐵劑和維生素，適度進行盆底肌訓練有助于改善里急后重癥狀。出現持續便血、體重下降或發熱等警報癥狀時須立即就醫。
