麻仁軟膠囊不宜與抗膽堿藥、中樞抑制劑及強心苷類藥物合用。藥物相互作用可能影響療效或增加不良反應風險，合用前需咨詢醫師。
麻仁軟膠囊主要成分為火麻仁、苦杏仁等，具有潤腸通便作用。與抗膽堿藥如阿托品、山莨菪堿合用時，可能減弱腸道蠕動作用，降低通便效果。中樞神經系統抑制劑如苯巴比妥、地西泮與麻仁軟膠囊合用可能增強鎮靜效果，導致過度抑制。強心苷類藥物如地高辛與麻仁軟膠囊聯用需謹慎，因電解質紊亂可能誘發強心苷中毒。
特殊情況下，正在服用降壓藥或抗凝藥的患者也需注意潛在相互作用。腸梗阻患者禁用麻仁軟膠囊，孕婦及過敏體質者應在醫師指導下使用。
若需聯合用藥，建議間隔2小時以上服用，并密切觀察排便情況、心率及意識狀態。出現心悸、頭暈或排便習慣異常時應及時就醫。
