根尖周炎的治療藥物選擇主要有抗生素、非甾體抗炎藥和根管消毒藥物三類。
抗生素主要用于控制細菌感染，常用藥物包括阿莫西林、甲硝唑和克林霉素。阿莫西林對多數口腔厭氧菌有效，甲硝唑針對厭氧菌感染效果顯著，克林霉素適用于青霉素過敏患者。使用抗生素需嚴格遵循醫囑，避免耐藥性產生。
非甾體抗炎藥可緩解根尖周炎引起的疼痛和炎癥，常用藥物有布洛芬、對乙酰氨基酚和雙氯芬酸鈉。這類藥物通過抑制前列腺素合成減輕癥狀，但長期使用可能引發胃腸道不適，需短期按需服用。
根管消毒藥物用于輔助根管治療，常見如氫氧化鈣糊劑、樟腦酚和碘仿。氫氧化鈣糊劑具有抗菌和促進硬組織修復的作用，樟腦酚可殺菌鎮痛，碘仿能持久抑制微生物生長。這類藥物需由專業牙醫在根管治療中操作使用。
根尖周炎藥物治療需結合臨床檢查結果，輕度感染可能僅需非甾體抗炎藥，嚴重感染或伴有膿腫時需聯用抗生素。若藥物治療效果不佳或病情反復，建議及時進行根管治療或手術干預。
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