舌部血管瘤的病因主要與胚胎期血管發育異常有關，具體可分為先天性因素和后天性刺激兩類。先天性因素占主導地位，包括血管內皮細胞異常增殖、遺傳基因突變等；后天性因素可能與局部創傷、激素水平變化有關。
先天性發育異常是舌部血管瘤最常見的病因。胚胎期血管形成過程中，部分血管內皮細胞增殖失控，導致血管結構紊亂。這種異常可能由VEGFR2、TIE2等基因突變引發，表現為血管內皮生長因子信號通路持續激活。部分患者存在家族遺傳傾向，尤其多發性血管瘤病例中約20%與遺傳相關。
激素水平變化是女性患者的重要誘因。妊娠期雌激素水平升高可刺激血管內皮細胞增殖，導致原有血管瘤增大或新發病變。青春期女性患者病情進展較快，可能與性激素受體表達增加有關。臨床觀察顯示約30%的女性患者血管瘤在月經周期中會出現體積波動。
局部創傷可能誘發創傷性血管瘤。舌部頻繁接觸牙齒或咀嚼硬物造成的微小損傷，可能引起血管內皮修復異常。這種類型通常表現為單發、界限清楚的紫紅色結節，組織學檢查可見血栓機化和新生血管形成。
部分舌部血管瘤與病毒感染存在關聯。人類皰疹病毒8型感染可導致血管內皮細胞轉化，通過分泌病毒IL-6等細胞因子促進血管增生。這類血管瘤多伴有免疫抑制狀態，在艾滋病或器官移植患者中發病率顯著增高。
少數病例與全身性疾病相關。遺傳性出血性毛細血管擴張癥患者的口腔血管瘤發生率可達40%，與ENG、ACVRL1基因突變有關。Klippel-Trenaunay綜合征等血管畸形疾病也常伴發舌部血管病變，需通過全身檢查排除綜合征可能。
