男性不育的癥狀表現多樣，主要與生殖系統功能障礙相關。常見癥狀包括精液異常、性功能障礙、局部不適等，部分患者可能無明顯自覺癥狀。
精液異常是最直接的臨床表現。精液量少于1.5毫升可能提示精囊發育不良或射精管梗阻；精液液化時間超過60分鐘可能與前列腺炎相關；精子濃度低于1500萬/毫升、活力不足40%或正常形態率低于4%均屬于異常指標。部分患者會出現血精癥狀，可能與精囊炎、結核等疾病有關。
性功能障礙是常見伴隨癥狀。勃起功能障礙可能導致無法完成性生活；早泄可能影響精液正常輸送；性欲減退可能與內分泌異常相關。部分患者存在射精障礙，如逆行射精精液進入膀胱或不射精癥。
局部體征需引起重視。陰囊墜脹感可能提示精索靜脈曲張，該疾病會導致睪丸溫度升高；睪丸體積小于12毫升可能影響生精功能；附睪結節可能提示慢性炎癥。部分患者會陰部疼痛可能與慢性前列腺炎有關。
內分泌異常相關癥狀不容忽視。男性乳房發育可能提示雌激素水平升高；體毛稀疏可能與雄激素不足相關；嗅覺喪失伴性腺發育不良需考慮卡爾曼綜合征。甲狀腺功能異常也可能導致生精障礙。
約30%患者屬于特發性不育，雖經全面檢查仍無法明確病因。這類患者可能僅表現為配偶未孕，無其他明顯癥狀。建議有生育需求的夫婦未避孕1年以上未孕時，男方應進行精液分析、生殖系統超聲、性激素等基礎檢查。
