支原體肺炎的傳染期通常為1-3周，具體時長與個體免疫狀態及治療情況相關。
支原體肺炎的傳染性隨病程進展變化。潛伏期感染后1-4周已具備弱傳染性，病原體可通過飛沫傳播；癥狀期咳嗽發熱后2-3周傳染性最強，此時患者呼吸道分泌物中含大量支原體；恢復期癥狀緩解后1-2周傳染性逐漸減弱，但完全清除病原體前仍存在傳播風險。兒童及免疫力低下者的傳染期可能延長至4周。
及時使用大環內酯類抗生素如阿奇霉素、克拉霉素可將傳染期縮短至5-7天。未規范治療者，即使癥狀消退仍可能攜帶病原體達1個月。合并基礎疾病如慢性支氣管炎或吸煙人群，呼吸道纖毛清除功能受損，會延長病原體排出時間。嬰幼兒因免疫系統未完善，傳染期較成人平均多7-10天。
疾病全程需做好呼吸道隔離，癥狀消失后繼續觀察1周。保持每日2次30分鐘以上的室內通風，患者衣物需60℃以上高溫清洗。康復期可進行八段錦等溫和運動增強膈肌力量，飲食側重百合、銀耳等潤肺食材，避免辛辣刺激食物誘發咳嗽。密切接觸者若出現咽痛、低熱等癥狀，建議盡早就診進行咽拭子檢測。
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