龜頭流膿伴小便刺痛常見于泌尿生殖系統感染，需根據病原體類型選擇針對性藥物。主要致病菌包括淋球菌、衣原體、支原體等，臨床常用抗生素有頭孢曲松鈉、阿奇霉素、多西環素等。
淋球菌感染首選頭孢類抗生素，頭孢曲松鈉通過抑制細菌細胞壁合成發揮殺菌作用，對β-內酰胺酶穩定的菌株仍有效。衣原體或支原體感染推薦大環內酯類藥物，阿奇霉素可阻斷病原體蛋白質合成，組織穿透性強。四環素類的多西環素對非典型病原體有良好抑制作用，需注意光敏反應等不良反應。
混合感染時可考慮聯合用藥方案，如頭孢曲松鈉聯合阿奇霉素。治療期間應避免性生活，性伴侶需同步檢查治療。喹諾酮類藥物因耐藥率升高已不作為首選，僅在藥敏試驗敏感時使用。
出現癥狀后建議盡早就醫進行分泌物涂片、尿常規及細菌培養檢查。未明確病原體前避免自行用藥，錯誤使用抗生素可能導致菌群失調或耐藥性產生。治療期間需保持局部清潔干燥，避免辛辣刺激飲食。
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