蒙脫石散也是可以用來外敷肛門的，但是主要是針對肛門周圍的皮膚或者是黏膜組織出現了濕疹的情況，或者是肛門局部由于腹瀉或者長時間臥床，局部透氣性差等因素，導致過度潮濕的情況下，還有一些嬰幼兒長時間使用尿不濕，可以通過肛門局部外敷蒙脫石散，起到一定的預防效果，如果需要蒙脫石散外敷肛門，需要在醫師或藥師的指導下進行使用。
蒙脫石散主要是作為口服藥物在臨床上進行應用，針對成年人以及兒童發生的急慢性腹瀉進行治療，是臨床上較為常用的止瀉藥物，其主要作用是吸附腸道內的病原體，從而對腸道內的菌群進行調節，平衡正常菌群。此外，對腸道黏膜組織也具有一定的保護作用。蒙脫石散主要是以改善腹瀉的癥狀為主，對于引起腹瀉的原發因素起不到治療作用，如果腹瀉是由于細菌感染引起，還要同時使用抗生素藥物對癥治療。
蒙脫石散主要是使用溫水溶化后進行口服，腹瀉的患者通常是在兩餐之間進行服用，如果是腹瀉患者，通過外敷蒙脫石散的方法治療，則沒有較好效果，沒有必要使用這種方法止瀉，必要時及時到醫院就診，遵醫囑服用止瀉藥物治療。
