隱匿陰莖可能是先天性的，也可能由后天因素導致，常見原因包括陰莖皮膚發育異常、肥胖、包皮環切術后瘢痕粘連、激素水平異常、局部感染或創傷。
1、發育異常：
先天性隱匿陰莖多與胚胎期陰莖皮膚與陰莖體附著異常有關，表現為陰莖體被埋藏于恥骨區皮下脂肪中。此類情況需通過手術矯正，常見術式為陰莖松解術聯合包皮成形術。
2、肥胖因素：
兒童或成人肥胖會導致恥骨前脂肪堆積，使陰莖外觀短小。控制體重是關鍵，需減少高糖高脂飲食，增加慢跑、游泳等有氧運動，脂肪減少后陰莖顯露程度可改善。
3、手術粘連：
包皮環切術后若護理不當可能形成瘢痕粘連，限制陰莖伸展。輕度粘連可通過局部涂抹激素藥膏如糠酸莫米松緩解，嚴重者需行粘連松解術。
4、激素失衡：
雄激素分泌不足可能影響陰莖發育，常見于隱睪或克氏綜合征患者。需檢測睪酮水平，必要時補充十一酸睪酮或丙酸睪酮，并治療原發病。
5、感染創傷：
反復龜頭炎或陰莖外傷可能導致皮膚攣縮。急性期需用抗生素如頭孢克肟、阿莫西林控制感染，慢性瘢痕需結合物理治療促進組織軟化。
日常需保持會陰清潔，避免穿緊身褲摩擦刺激。飲食建議增加富含鋅元素的海產品、堅果，促進生殖系統發育。6歲以上兒童若陰莖顯露長度持續不足1厘米，或伴有排尿困難，需盡早就醫評估手術指征。術后需定期隨訪觀察陰莖生長情況，青春期前每年測量陰莖長度變化。
