治療急性腸胃炎的藥物主要是止瀉的藥物，如蒙脫石散，配合一些緩解惡心的藥物，如多潘立酮，同時加用一些調理腸胃功能的益生菌，如雙歧桿菌等進行治療。
急性腸胃炎可導致患者出現腹瀉、嘔吐現象，多與進食不潔食物有關，應根據原因及癥狀進行治療，常見治療藥物如下，對因治療：若為細菌感染，可考慮使用治療消化道的抗生素治療，如青霉素類的阿莫西林，以及二代、三代頭孢，包括頭孢克肟、頭孢呋辛。成年人可選擇喹諾酮類消炎藥，如左氧氟沙星類。對癥治療：針對消化道癥狀進行相關治療，如嘔吐時，可考慮使用胃復安以及黏膜保護劑，如鋁碳酸鎂咀嚼片、鋁鎂加混懸液、替普瑞酮等。若患者胃酸過多，導致明顯反酸、燒心等癥狀時，可考慮使用抑酸藥物，如質子泵抑制劑類，包括雷貝拉唑、奧美拉唑、泮托拉唑等。除此之外，針對下消化道癥狀，如腹瀉，此時患者可考慮使用蒙脫石散、黃連素以及腸道益生菌，如雙歧桿菌、枯草桿菌、嗜酸乳桿菌等治療。若嘔吐、腹瀉較為明顯，則補液較為重要。若患者可經口服用，建議經口補液或考慮加用口服補液鹽，防止患者出現電解質紊亂。
急性腸胃炎病情較重患者可以吃些流質食物，比如濃米湯、面湯、雞湯、濃豆漿、豆腐腦等，病情比較輕患者可以吃些低渣半流質飲食，食物要求細軟、容易消化，比如可以吃白米粥、蛋羹、雞湯掛面、西紅柿炒雞蛋等，不含韭菜、芹菜、蓮藕等粗纖維蔬菜，飲食以清淡及富含水分為宜，忌油膩、刺激性食物及海鮮。有急性腸胃炎的患者應注意多休息、多飲水、避免勞累、戒煙酒。
