1.抗菌治療
目前多主張喹諾酮類藥物如氧氟沙星或左旋氧氟沙星。若無效繼續用8周。復發且菌種不變，改用預防劑量以減少急性發作，使癥狀減退。長期應用抗生素若誘發嚴重副反應，如假膜性腸炎、腹瀉，腸道耐藥菌株滋長等，需更換治療方案。此外，用雙球囊導尿管封閉前列腺部尿道，從尿道腔注入抗生素溶液反流入前列腺管，亦可達到治療目的。
2.消炎、止痛藥
非甾體抗炎藥可改善癥狀，一般使用消炎痛內服或栓劑，中藥使用消炎、清熱、解毒、軟堅藥物亦收到一定效果。別嘌醇能降低全身及前列腺液中的尿酸濃度，理論上它作為自由基清除劑，還可清除活性氧成分，減輕炎癥，緩解疼痛。不失為可選用的輔助治療方法。
3.物理治療
前列腺按摩可排空前列腺管內濃縮的分泌物以及引流腺體梗阻區域的感染灶，因此對頑固病例可在使用抗生素的同時每3～7天做前列腺按摩。多種物理因子被用作前列腺理療，如微波、射頻、超短波、中波和熱水坐浴，對松弛前列腺、后尿道平滑肌及盆底肌肉，加強抗菌療效和緩解疼痛癥狀有一定好處。
4.前列腺按摩及熱療
前列腺按摩是傳統的治療方法之一，研究顯示適當的前列腺按摩可促進前列腺管排空，增加局部藥物濃度，進而緩解慢性前列腺炎的臨床癥狀。熱療主要利用多種物理手段所產生的熱效應，增加前列腺組織血液循環，加速新陳代謝，有利于效應和消除組織水腫，緩解盆底肌肉痙攣等。
5.手術治療
外科治療可用于反復發作的慢性細菌性前列腺炎。前列腺摘除能夠達到治愈的目的，但是要慎用。由于前列腺炎通常累及腺體的外周帶，因此，前列腺電切術難以達到治療的目的TURP能夠去除前列腺的結石和前列腺導管附近的細菌感染病灶，有益于降低外周帶病灶的再感染。慢性細菌性前列腺炎可導致反復尿路感染及不育。
6.其他治療
包括了生物反饋治療，經會陰體外沖擊波治療，心理治療，中醫中藥治療等。
