雙金胃腸膠囊不宜與抗酸藥、抗菌藥物、抗凝血藥、消化酶制劑及含金屬離子的藥物合用。雙金胃腸膠囊為中成藥，成分復雜，聯合用藥可能影響藥效或增加不良反應風險。
1、抗酸藥
雙金胃腸膠囊含有多種中藥成分，與氫氧化鋁、碳酸氫鈉等抗酸藥同服時，可能因胃酸被中和而影響藥物有效成分的溶解和吸收。抗酸藥會改變胃腸道pH值，導致雙金胃腸膠囊中某些成分的生物利用度下降，降低治療效果。建議間隔兩小時以上服用，避免直接相互作用。
2、抗菌藥物
諾氟沙星、左氧氟沙星等喹諾酮類抗菌藥物可能與雙金胃腸膠囊中的金屬離子形成螯合物，影響抗菌活性。四環素類抗生素也會因金屬離子結合而降低吸收率。中藥成分可能干擾腸道菌群平衡，間接影響抗菌藥物療效，需在醫生指導下調整用藥方案。
3、抗凝血藥
華法林等抗凝劑與雙金胃腸膠囊合用時需謹慎，部分中藥成分可能含有天然維生素K或影響肝臟代謝酶活性，導致凝血功能波動。長期聯用可能增加出血或血栓風險，需密切監測凝血酶原時間國際標準化比值，必要時調整抗凝藥物劑量。
4、消化酶制劑
胰酶、多酶片等消化酶制劑與雙金胃腸膠囊可能存在相互作用。中藥成分可能改變胃腸道環境，影響消化酶的活性發揮。部分中藥可能含有蛋白酶抑制劑類物質，直接降低胰蛋白酶功效，建議分開時段服用以保障各自療效。
5、含金屬離子藥物
硫酸亞鐵、葡萄糖酸鋅等補充劑中的金屬離子易與雙金胃腸膠囊中的鞣質、黃酮類成分結合形成沉淀，阻礙雙方吸收。鈣劑也可能干擾某些活性成分的溶解性，建議至少間隔三小時服用，必要時通過血藥濃度監測評估相互作用程度。
使用雙金胃腸膠囊期間應主動告知醫生正在服用的所有藥物，包括處方藥、非處方藥及保健品。服藥期間避免飲酒及辛辣刺激性食物，保持規律飲食有助于胃腸功能恢復。若出現惡心、皮疹等不適癥狀應及時停藥就醫，老年人及肝腎功能不全者需在醫師指導下調整用藥方案。中藥與西藥聯用需考慮代謝途徑和藥效學特點，不建議自行組合用藥。
