小柴胡顆粒不宜與解熱鎮痛藥、抗生素、含麻黃堿類藥物、免疫抑制劑及抗凝藥物同時服用。聯合用藥可能引發藥物相互作用，導致藥效降低或不良反應風險增加。
1、解熱鎮痛藥：
小柴胡顆粒中的柴胡、黃芩等成分具有解表退熱作用，與布洛芬、對乙酰氨基酚等解熱鎮痛藥聯用可能增強發汗效果，增加脫水風險。兩類藥物均需通過肝臟代謝，合用可能加重肝臟負擔。
2、抗生素：
部分抗生素如左氧氟沙星、阿奇霉素與小柴胡顆粒同服可能形成絡合物，影響藥物吸收。黃芩苷成分可能干擾腸道菌群平衡，降低抗生素療效，建議間隔2小時以上服用。
3、含麻黃堿藥物：
麻黃堿類感冒藥與小柴胡顆粒均含升散之性，聯用可能導致血壓波動、心悸等交感神經過度興奮癥狀。高血壓患者尤其需避免復方鹽酸偽麻黃堿緩釋膠囊等藥物與小柴胡顆粒合用。
4、免疫抑制劑：
小柴胡顆粒可通過調節免疫功能發揮治療作用，與環孢素、他克莫司等免疫抑制劑聯用可能產生拮抗效應。器官移植術后患者需嚴格避免合用，防止排斥反應或藥效減弱。
5、抗凝藥物：
小柴胡顆粒中黃芩素可能抑制血小板聚集，與華法林、利伐沙班等抗凝藥聯用可能增加出血傾向。術前兩周應停用小柴胡顆粒，定期監測凝血酶原時間國際標準化比值。
服用小柴胡顆粒期間建議保持清淡飲食，避免辛辣刺激食物影響藥效吸收。用藥后適當增加飲水量促進代謝，服藥期間不宜飲用濃茶或咖啡。慢性病患者聯合用藥前需咨詢醫師，服藥后出現皮疹、惡心等不適及時就醫。中藥調理期間建議規律作息，避免過度勞累影響機體自我修復能力。
