在懷孕的前三個月，為控制甲狀腺功能亢進，首選丙基硫氧嘧啶。從懷孕三個月后，可以使用甲巰咪唑。還可以選擇一些中草藥和中成藥進行治療。藥物治療得當，甲狀腺功能亢進癥患者通常可以保持足月妊娠。
如果在懷孕期間發現甲狀腺功能亢進，則必須控制甲狀腺功能亢進的發展和胎兒的正常生長。必須嚴格進行產前檢查，因為患有甲狀腺功能亢進的孕婦容易發生胎兒早產，死產，子宮內發育異常和妊娠高血壓，那么妊娠合并甲亢吃什么藥？
妊娠合并甲亢，較輕者可以通過抗甲狀腺藥物適當控制以繼續妊娠，可以服用他巴達唑或丙基硫氧嘧啶。治療甲狀腺功能亢進癥藥物目的是將母親的甲狀腺功能控制在輕度甲狀腺功能亢進或正常上限，并防止胎兒甲狀腺功能亢進或甲狀腺功能低下。
對于妊娠合并甲亢的治療，目前認為，在考慮使用藥物之前，激素水平高于正常值的1.4倍，丙基硫氧嘧啶是懷孕期間的首選藥物，但劑量很小，癥狀得到控制后，維持率降低。最好不要在預產期前3周內使用該藥物。在此過程中，如果有嚴重的并發癥，例如心臟病或高血壓，則應考慮終止妊娠。如果治療得當，甲狀腺功能亢進癥患者通常可以保持足月妊娠。可以嘗試獲得陰道分娩，注意防止分娩時感染和大量出血，以防止甲亢的發生。
第一種抗甲狀腺藥物，代表性藥物是丙基硫氧嘧啶，在孕早期可以服用，在懷孕的前三個月，為控制甲狀腺功能亢進，首選丙基硫氧嘧啶。第二種是甲巰咪唑，也是一種常見的抗甲狀腺藥物。因從懷孕三個月后，可以使用甲巰咪唑。第三是可以選擇一些中草藥和中成藥進行治療。在臨床上，通常會選擇一些抗甲狀腺藥物，例如夏枯草口服液，對甲狀腺功能亢進癥有很好的治療作用。
懷孕1到3個月，胎兒的甲狀腺尚未成熟，并且不具有碘吸收的功能。此時，可以使用足夠的抗甲狀腺藥物進行治療。所用劑量應能夠盡快控制甲狀腺功能亢進的癥狀，以利于減少妊娠中期和晚期。從4月到6月，胎兒的甲狀腺功能已基本成熟，應將抗甲狀腺藥降低劑量。由于抗甲狀腺藥物可以通過胎盤，因此大劑量使用時，會引起胎兒甲狀腺腫和甲狀腺功能減退，影響大腦發育，甚至患克汀病。7月至9月以及胎兒出生之前是大腦發育的關鍵。抗甲狀腺藥的劑量應進一步減少或停止。
